В 2006 году Южно-Уральской железной дороге — филиалу ОАО «РЖД» из бюджетов Челябинской, Оренбургской и Курганской областей в счет компенсации выпадающих доходов от перевозок пассажиров в пригородном сообщении перечислено 85,5 миллионов рублей.
Взаимодействие Южно-Уральской магистрали с Правительствами Челябинской, Оренбургской и Курганской областей строится на основе ежегодных соглашений о взаимодействии и сотрудничестве.
Из региональных бюджетов Челябинской, Оренбургской и Курганской областей в 2006 году Южно-Уральской железной дороге было перечислено 200,5 миллиона рублей. В том числе за регулирование тарифов на пригородные перевозки перечислено 85,5 миллиона рублей (из них 30 миллионов рублей были перечислены на капитальный ремонт вокзала станции Оренбург); по долевому участию в строительстве пригородной зоны станции Челябинск-Главный из бюджета Челябинской области перечислено 115 миллионов рублей.